Дочерняя структура Московской школы управления «Сколково» — ООО «УК Сколково менеджмент», которую возглавляет Александр Ким, вступила в затяжной правовой конфликт с Министерством науки и высшего образования РФ вокруг соглашения о предоставлении федеральной субсидии на сопровождение государственной программы поддержки студентов, обучающихся в ведущих иностранных вузах. Компания пыталась добиться расторжения соглашения 2014 года, ссылаясь на прекращение финансирования после продления срока реализации программы до 2025 года.
Министерство, в свою очередь, подало встречный иск: ведомство не только потребовало расторгнуть то же соглашение, но и взыскать 260 млн рублей как неосновательное обогащение, утверждая, что оператор программы допустил существенные нарушения и не обеспечил выполнение ключевых задач, включая возврат средств от участников, нарушивших условия программы. По данным Генпрокуратуры, невзысканными остались 353 млн рублей.
Первая инстанция и апелляция отказали обеим сторонам, однако кассация вмешалась и направила дело на новое рассмотрение в части встречного иска Министерства. Суд округа указал, что «Сколково менеджмент» при подписании допсоглашения в 2017 году взяло на себя риск работы без дополнительного финансирования, а потому требований компании о расторжении соглашения из-за отсутствия новых бюджетных средств удовлетворять нельзя. Зато доводы министерства о существенных нарушениях оператором программы, по мнению кассации, были изучены судами недостаточно тщательно.
При новом рассмотрении суд пришел к выводу, что выявленные прокуратурой нарушения — от отсутствия надлежащей претензионной работы до многолетнего невозврата средств — действительно подтверждают ненадлежащее исполнение условий соглашения оператором. Доказательств устранения нарушений общество не представило, тогда как прокуратура настаивала на обратном.
В итоге суд счел, что цели соглашения достигнуты не были, а нарушения носят существенный характер. При этом расторжение соглашения, как подчеркнул суд, не ставит под угрозу права участников программы: министерство вправе провести новый конкурс и выбрать другого оператора.
Решением суда договор от 2 октября 2014 года был расторгнут по инициативе Минобрнауки. С «УК Сколково менеджмент» постановлено взыскать 260 млн рублей как неосновательное обогащение. Попытка компании оспорить доводы министерства в Верховном суде успехом не увенчалась — передача жалобы была отклонена.

